L’origine remonte à 1420
Le Palais Ducal a été commandé par le huitième Comte de Barcelos (qui devient, plus tard, premier Duc de Bragança), D. Afonso, fils illégitime du roi D. João I et de D. Inês Pires Esteves. Sa construction a eu lieu entre 1420 et 1433.
Bien qu’illégitime, D. Afonso a toujours été soutenu par son père, D. João I, fondateur de la dynastie d’Avis, qui lui a fait des grandes donations. En 1401, D. Afonso se marie avec D. Beatriz, fille du Connétable D. Nunes Álvares Pereira, date à partir de laquelle il commence à porter le titre de huitième Comte de Barcelos.
La construction du Palais Ducal a dû commencer vers 1420, au même temps que le deuxième mariage de D. Afonso avec D. Constança de Noronha, fille du Comte de Gijón.
D. Afonso voyage à travers l’Europe pour des engagements diplomatiques et sur initiative personnelle. Il a voyagé en Angleterre, Écosse, Espagne, France et Italie, ayant aussi participé dans des campagnes militaires à Ceuta. Ces voyages ont surement influencé sa vision sur le monde comme aussi sur son mode de vie. Elles ont aussi influencé la manière dont il a édifié le Palais Ducal à Guimarães.
C’est dans l’année 1442 que son frère, D. Pedro, à l’époque Régent, lui accorde le titre de Duc de Bragança, donnant ainsi origine à une des plus riches et plus puissantes maisons seigneuriales de la Péninsule Ibérique – La Maison de Bragança.
Après la mort de D. Afonso (1461), la duchesse veuve continue à habiter le Palais Ducal jusqu’à sa mort en 1480. Selon la tradition, elle aurait créé ici un espace destiné à accueillir des malades et des personnes nécessités.
On pense que durant le XVe siècle le Palais Ducal a été utilisé comme lieu de résidence par le Duc de Bragança, rentrant ensuite progressivement dans une phase d’abandon, ayant comme conséquence sa ruine. Preuve de cet abandon c’est l’autorisation donné, en 1666, aux moines capucins de Guimarães d’y retirer de la pierre pour la construction de leur couvent.
Au XIXe siècle, à l’époque des invasions françaises, le Palais Ducal a été utilisé comme Caserne Militaire. Et, au siècle suivant, pendant le régime de l’État Nouveau, le Palais Ducal est reconstruit sur la direction de l’architecte Rogério de Azevedo.
Cette intervention a eu lieu entre 1937 et 1959, ayant été inauguré le 25 juin 1959, l’année qu’il est devenu Résidence Officielle du Président de la République au Nord du Pays.